Nüfusu hızla artan Cumhuriyet Mahallesi' nin 1986 yılında ortaokulunun olmaması nedeniyle öğrencilerinin bin bir güçlükle öğrenim görmek üzere çevre okullara gittikleri, bu nedenle de mah alleye bir ortaokul yapılmasının zorunlu hale geldiğinden, Karşıyaka Belediyesi tarafından Özel İdareye hibe edilen arsa üzerine kurulu bulunan okulumuz, 1986 – 1987 Öğretim yılında eğitim-öğretime açılmıştır.
         Başlangıçta 9 derslik olarak planlanan okul binasına Karşıyaka Yalı Caddesinde bulunan dairesini bağışlayan hayırsever Mürşide ALTINÇUBUK' un adı verilmiştir.

         Okul Binası 24.10.1985' te 50.000.000 TL. ye ihale edilmiştir. İhaleyi müteahhit İsmail ÇOLAKOĞLU almıştır. 09.12.1985 günü dönemin başbakan vekili Kaya Erdem, vali, kaymakam, Milli Eğitim müdürü, diğer mülki erkan ile okula adı verilen yardımsever Mürşide Altınçubuk Hanımefendi ve çevre halkının katılımıyla temeli atılmıştır.İnşaat 8 aylık bir sürede tamamlanarak 19.08.1986'da bitirilmiştir.

  
         Okul binası 9 derslik, 4 hizmet odası 1 çok amaçlı salon olarak planlanmış ve hizmete sunulmuştur.
         Okulumuz 1986 – 1997 öğretim yılında 1 müdür, 15 öğretmen, 1 hizmetli, 1 memur ve 254 öğrenci ile normal öğretim şeklinde eğitim öğretime başlamıştır.
         1987 – 1988 öğretim yılından itibaren ikili öğretime geçen okulumuza, artan bu ihtiyaç nedeniyle Milli Eğitim Müdürlüğünce 1990 yılında 6 derslikli ek bina daha yaptırılmıştır. Bu binanın hizmete girmesiyle, tekrar normal öğretime dönülmüştür.
        1990 yılında bahçe duvarları çekilmiş, 1991 yılında bahçenin tamamı asfaltlanmıştır. Kalorifer sistemi hayırsever Mürşide Altınçubuk' un gayret ve destekleriyle 1993 yılında tamamlanmıştır.
        Okulumuz 1995 – 1996 öğretim yılında öğrenci sayısının artmasıyla tekrar ikili öğretime geçmiştir.
        18.08.1997 tarihinde yürürlüğe giren 4306 sayılı yasa gereğince okulumuz ilköğretime dönüşmüştür.
        2012 yılında tekrar orta okul olmuştur.